Después de proteger a Last Order a costa de gran parte de su poder, Accelerator se ver arrastrado a un nuevo conflicto en forma de una siniestra organización llamada DA (Disciplinary Action) que planea usar a Last Order para una misión peligrosa.
Ahora que han puesto en marcha su plan y están persiguiendo a la joven, depende del esper mas poderoso del mundo y su nueva compañera, la nigromante Esther Rosenthal, proteger a Last Order y defender a Ciudad Academia en el proceso.